张法

中国科学院计算技术研究所

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  • 张法
  • 研究员
简历:

2018年9月 — 今:中国科学院计算技术研究所,研究员 2008年4月 — 2018年9月:中国科学院计算技术研究所,副研究员2 2005年7月 — 2008年4月:中国科学院计算技术研究所,助理研究员 2002年11月 — 2005年4月:Ohio State University,访问学者 2000年9月 — 2005年7月:中国科学院计算技术研究所,博士生 1997年9月 — 2000年7月:燕山大学,计算机学院,硕士生 1993年9月 — 1997年7月:河北科技大学,计算机学院,本科生

研究方向:
生物医学图像处理、高性能计算、生物信息学
社会任职:

中国计算机学会(CCF)生物信息学专委会 秘书长

获奖及荣誉:
代表论著:

[1].Renmin Han, Xiaohua Wan, Lun Li, Albert Lawrence, Peng Yang, Yu Li, Sheng Wang, Fei Sun, Zhiyong Liu, Xin Gao, Fa Zhang*. AuTom-dualx: a toolkit for fully automatic fiducial marker-based alignment of dual-axis tilt series with simultaneous reconstruction. Bioinformatics, 2018. [2].Renmin Han, Fa Zhang, Xin Gao. A fast fiducial marker tracking model for fully automatic alignment in electron tomography. Bioinformatics. 2018 Mar 1; 34(5): 853–863. [3].Zihao Wang, Yu Chen, Jingrong Zhang, Lun Li, Xiaohua Wan, Zhiyong Liu, Fei Sun, Fa Zhang*. ICON-MIC: Implementing a CPU/MIC Collaboration Parallel Framework for ICON on Tianhe-2 Supercomputer. Journal of Computational Biology. 2018, 25(3): 270-281. [4].Rui Yan, Fei Ren, Zihao Wang, Lihua Wang, Yubo Ren, Yudong Liu, Xiaosong Rao, Chunhou Zheng, and Fa Zhang. A Hybrid Convolutional and Recurrent Deep Neural Network for Breast Cancer Pathological Image Classification. The 2018 International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Regular Paper. [5].Fan Xu, Mingshu Zhang, Wenting He, Renmin Han, Fudong Xue, Zhiyong Liu, Fa Zhang*, Jennifer Lippincott-Schwartz*, Pingyong Xu*. Live cell single molecule guided Bayesian localization super resolution microscopy. Cell Research, 2017, May; 27(5): 713–716. [6].Fa Zhang, Yu Chen, Fei Ren, Xuan Wang, Zhiyong Liu, Xiaohua Wan. A Two-Phase Improved Correlation Method for Automatic Particle Selection in Cryo-EM. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2017, 14(2): 316-325. [7].Renmin Han, Xiaohua Wan, Zihao Wang, Yu Hao, Jingrong Zhang, Yu Chen, Xin Gao, Zhiyong Liu, Fei Ren, Fei Sun, Fa Zhang. AuTom: a novel automatic platform for electron tomography reconstruction, Journal of Structural Biology, 2017, 199(3):196.

承担科研项目情况:

[1].国家重点研发计划,“蛋白质机器的冷冻电镜亚纳米分辨率原位结构解析技术及应用”,子课题负责人,项目编号:2017YFA0504702, 2017.07 – 2022.06. [2].国家重点研发计划政府间专项,“基于DNA自组装的纳米载药系统研究”,子课题负责人,项目编号:YS2017YFGH000151, 2018.01 – 2020.12. [3].国家自然科学基金-广东联合基金重点项目,“面向典型疾病的高精度生物大分子三维结构研究”,执行负责人,项目编号:U1611263, 2017.01 – 2020.12. [4].国家自然科学基金-广东联合基金重点项目,“基于天河二号的生物医学健康大数据应用支撑平台”,子课题负责人,项目编号:U1611261, 2017.01 – 2020.12. [5].国家自然科学基金国际合作重点项目“高效能数据中心-数据中心资源的优化组织与调度”课题组执行负责人,项目编号:61520106005,2016.01 – 2020.12

学科类别:
计算机系统结构
所属部门:
高性能计算机研究中心
专家类别:
正高
杰青入选时间:
百人入选时间:
其他备注:
博导计算机系统结构
其他备注2:
其他备注3: