面向深度测序的数据处理一体机

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项目简介

研究开发面向健康医疗单位和生物信息学研究单位的深度基因测序数据存储分析一体机,其定位是以高性能计算和存储技术为基础、以整合优化的行业应用软件为核心,为目标客户提供专用的一体机产品,支撑其基因测序相关数据分析业务。一体机将集成高性能计算机硬件和软件,利用可重构计算加速及编程模型,开发新型的基因组拼接算法及软件、短序列定位算法的加速方法、基因序列压缩存储方法、基因大数据处理系统平台及计算存储一体机,将基因数据处理速度提高一个数量级,并有效降低数据处理成本。一体机系统将支持超过64个CPU核心和500TB存储,能够满足一般生物信息类企事业单位的数据处理需求。系统将集成FPGA和GPU加速部件,优化实现最常用的并行基因拼接、宏基因组、RNA-Seq、人重测序等流程,与常规处理方式相比,具有数量级的速度提升。

应用领域

前沿信息产业。本项目将基于中国科学院计算技术研究所的前期973课题继续开展产品化研究工作,并将依靠计算所孵化企业北京中科吉因科技有限公司开展产品推广应用工作。预期至第五年,一体机销售额有望达到1亿元规模。

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