• 姓      名:    周　兵
• 职      务:   
• 职      称:    研究员
• 通讯地址:    北京市朝阳区北辰西路1号院5号

简历介绍：

周兵，男，博士，研究员，博士生导师，中国科学院动物研究所细胞微环境系统生物学研究组组长；中国科学院“百人计划”入选者。 2004年于湖南大学信息管理与信息系统系获得学士学位，2012年于中国科学院遗传与发育生物学研究所获得生物信息学博士学位，师从韩敬东研究员从事衰老系统生物学方向的研究。2012-2014年在中国科学院遗传发育所曹晓风实验室进行博士后研究工作，从事组蛋白去甲基化酶的表观遗传学精确调控机制的研究。2014-2018年在美国加州大学圣地亚哥分校UCSD付向东实验室进行博士后研究工作，从事RNA代谢调控网络与染色质高级结构的功能基因组方面的研究。研究内容主要围绕功能基因组学与表观遗传学的分子调控机制，结合计算生物学与系统生物学的方法，探索多基因的精确表达调控、表观遗传信息的靶向识别以及染色质的高级结构与功能，取得了一系列研究成果，分别发表于Nature Biotechnology、Nature Genetics、Genome Research、PNAS、RNA等SCI刊物上共15篇，其中发表第一或共一作者文章6篇，获得美国应用专利1项。（1）设计并开发了RNA-染色质互作组大规模测序技术GRID-seq的计算与分析流程，首次揭示了新生RNA转录活动受限于周围染色质的三维结构，表明空间临近的多基因形成活跃的社区结构，存在相互反馈调控的转录微环境（Nature Biotechnology 2017）。（2）揭示了真核生物核小体H3K27me3和H3K4me3的去甲基化酶REF6和JMJ14在高等植物中精确调控基因表达的序列依赖性识别与靶向机制（Nature Genetics 2016; Cell Discovery 2015）。（3）建立小鼠饮食与能量干预模型，揭示了能量限制相关调控通路，发现了能量过剩促进过氧化物酶体的过量增殖，显著降低了细胞对活性氧耐受程度，从而加速衰老进程（PNAS 2012）。（4）开发并实现了大规模数据的整合分析框架与流程，构建了多维异质性生物学大数据的贝叶斯网络推断与分析模型，成功地揭示了人类CD4阳性T细胞20多种核小体表观遗传学修饰的基因表达调控网络（Genome Research 2008）。

研究领域：

本实验室今后的研究重点将主要围绕细胞的身份决定与维持、干性与可塑性的细胞微环境、器官衰老与再生等科学问题，运用计算生物学与大规模高通量实验技术相结合的方法，从功能基因组学、表观遗传学、染色质高级结构以及单细胞生物学等方面，系统性地阐释多细胞微环境的性质、功能与分子调控机制。

社会任职：

获奖及荣誉：

承担科研项目情况：

代表论著：

Xiao Li^, Bing Zhou^, Liang Chen, Lan-Tao Gou, Hairi Li, Xiang-Dong Fu. GRID-seq reveals the global RNA-chromatin interactome. Nature biotechnology, 2017.Jinsong Qiu^, Bing Zhou^, Felicitas Thol, Yu Zhou, Liang Chen, Changwei Shao, Christopher DeBoever, Jiayi Hou, Hairi Li, Anuhar Chaturvedi, Arnold Ganser, Rafael Bejar, Dong-Er Zhang, Xiang-Dong Fu, Michael Heuser. Distinct splicing signatures affect converged pathways in myelodysplastic syndrome patients carrying mutations in different splicing regulators. RNA, 2016.Xia Cui^, Falong Lu^, Qi Qiu^, Bing Zhou^, Lianfeng Gu, Shuaibin Zhang, Yanyuan Kang, Xiekui Cui, Xuan Ma, Qingqing Yao, Jinbiao Ma, Xiaoyu Zhang, Xiaofeng Cao. REF6 recognizes a specific DNA sequence to demethylate H3K27me3 and regulate organ boundary formation in Arabidopsis. Nature genetics, 2016.Shuaibin Zhang^, Bing Zhou^, Yanyuan kang, Xia Cui, Ao Liu, Angelique Deleris, Maxim V. C. Greenberg, Xiekui Cui, Qi Qiu, Falong Lu, James A. Wohlschlegel, Steven E. Jacobsen and Xiaofeng Cao. C-terminal domains of histone demethylase JMJ14 interact with a pair of NAC transcription factors to mediate specific chromatin association. Cell Discovery, 2015.Bing Zhou^, Liu Yang^, Shoufeng Li, Jialiang Huang, Haiyang Chen, Lei Hou, Jinbo Wang, Christopher D. Green, Zhen Yan, Xun Huang, Matt Kaeberlein, Li Zhu, Huasheng Xiao, Yong Liu, and Jing-Dong J. Han. Midlife gene expressions identify modulators of aging through dietary interventions. PNAS, 2012.Hong Yu^, Shanshan Zhu^, Bing Zhou^, Huiling Xue, and Jing-Dong Jackie Han. Inferring causal relationships among different histone modifications and gene expression. Genome Research, 2008.

专利：

Xiang-Dong Fu, Bing Zhou, Xiao Li. Methods for global rna-chromatin interactome discovery. US patent, 2018: US20180039729A1.

写给考生的话：