徐自祥

中国科学院天津工业生物技术研究所

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  • 徐自祥
  • 副研究员
  • 天津空港经济区西七道32号

简历

一九六九年出生,安徽省合肥市庐江县人。

2009年起就职于中国科学院天津工业生物技术研究所,助理研究员至副研究员。

2009年博士后出站于东南大学,吴健雄实验室即生物电子学国家重点实验室,

生物医学工程博士后流动站,生物信息学方向。

2006年博士毕业于西北工业大学,电子信息学院,系统工程专业。

2001年硕士毕业于江苏大学,理学院,计算力学专业。

1995年本科毕业于合肥师范学院,物理系,物理专业。

1988年至1998年期间,于安徽省庐江县任中学物理教员。

研究方向:

研究方向定位于计算生物学,具有交叉学科的知识结构,致力于将数学方法和计算技术结合应用到生物学领域,以干助湿为生物学实验提供指导。

在生物信息学方面擅长各类组学数据处理,包括基因组、转录组、蛋白组、代谢组;在计算系统与合成生物学方面擅长代谢网络、调控网络等生物网络的建模、分析、设计。

在工业微生物应用方面关注化学品合成途径设计、蛋白酶与途径元部件设计、发酵与工艺过程模拟与优化。重点关注蛋白质的理性设计,并应用于多种工业酶的研发与改造;着力研究在组学大数据背景下工业微生物生理行为的解析和目标代谢瓶颈的发现,并应用于多种模式工业菌株的改造。

承担科研项目情况:

在天津工业生物所期间,负责国家自然科学基金面上项目1项、天津市自然科学基金面上项目1项和生物电子学国家重点实验室开放课题1项,作为主要成员参与973子课题、中国科学院项目、天津市科技支撑等多个科研项目。在这些项目中,主要工作是围绕基于虚拟细胞的普适性的菌株设计算法的开发和细胞网络模型化,同时为其他项目的需要提供计算生物学支持。

目前以第一作者发表计算生物学和信息技术方面中英文论文20多篇,连同合作论文30多篇。

获奖及荣誉:

2001年,硕士学位论文“结构拓扑优化研究与应用”获江苏大学优秀硕士学位论文。