• 姓      名:    秦燕
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• 职      称:    研究员
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简历 & 研究组工作摘要

1995-1999年 南开大学，生物学学士

2000-2006年 德国马-普学会，博士学位，留任博士后

2006年-- 中国科学院生物物理研究所研究员，RNA平台首席技术专家

2007年-- 创新课题组长，博士生导师

2008-2012年 中德生物技术青年科学家小组，中方组长

2014年-- 中国科学院大学 岗位教授

2014-2016年 国家“优秀青年基金”

主要研究方向：

1. 核糖体的结构和分子机理

蛋白质的生物合成过程是生命体中的核心反应，即遗传信息传递到蛋白质的全过程。我们研究的课题包括DNA对蛋白质表达的影响、mRNA研究、蛋白质在核糖体中的合成（核心课题）、新生肽链的折叠等方向，以及蛋白质生物合成的主要抑制剂——抗生素的研发。

2. 蛋白质翻译调控与疾病（主要是癌症）的关系

我们研究癌症的发生、恶化以及转移过程中对蛋白质翻译过程依赖的分子机制，从而建立疾病模型，进而为相关癌症的诊断、治疗提出新方案。

研究工作进展：

核糖体是蛋白质的合成工厂，它沿着mRNA从5'到3'方向运动，将遗传信息翻译成为肽链（蛋白质）。EF4（以前称为LepA，Guf1）蛋白是种极度保守的蛋白质，存在于几乎所有已知的基因组中，其同源物的氨基酸序列和结构域预测都有很高的相似性，但它的功能多年来一直未知。最近工作发现，EF4是核糖体作用蛋白，可以诱导核糖体在mRNA上倒退运动。我们继续这项工作，深入研究EF4及其同源蛋白的生物化学特性和生理学意义，在大肠杆菌、果蝇、线虫、小鼠以及人等模式生物中深入研究EF4蛋白的功能。

在肿瘤发生过程中，EF4也发挥重要的作用。同时，我们发现EF4与非编码核酸，主要是一些长的非编码核酸相互作用，协同调控肿瘤细胞的蛋白质翻译，从而影响肿瘤的形成、恶化以及转移，从而对癌症病人的诊断、治疗有重要意义。

代表性论文

1. Li G and Qin Y* (2018) A brief review: the mitochondrial translation factor EF4 regulated mitochondrial respiratory chain and induced the production of ROS, Free Radical Res. (accepted)

2. Zhou Z, Hu Y, Li A, Li Y, Zhao H, Wang S, Otecko NO, Zhang D, Wang J, Liu Y, Irwin DM, Qin Y & Ya-Ping Zhang* (2018) Genome wide analyses uncover allele-specific RNA editing in human and mouse，Nucleic Acids Res.https://doi.org/10.1093/nar/gky613

3. Wang F, Zhang L, Bai X, Cao X, Jiao X, Huang Y, Li Y, Qin Y* and Wen Y* (2018) (*corresponding author) Stimuli-Responsive Nanocarrier for Co-delivery of MiR-31 and Doxorubicin To Suppress High MtEF4 Cancer, ACS Applied Materials & Interfaces, doi: 10.1021/acsami.8b07698

4. Zhu P, Liu Y, Zhang F, Bai X, Chen Z, Shangguan F, Zhang B, Zhang L, Chen Q, Xie D, Lan L, Xue X, Liang X, LU B, Wei T, Qin Y* (2018) (*corresponding author) Human Elongation Factor 4 Regulates Cancer Bioenergetics by Acting as a Mitochondrial Translation Switch. Cancer research. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-17-2059.

5. Cao X, Qin Y* (2016) (*corresponding author) Mitochondrial translation factors reflect coordination between organelles and cytoplasmic translation via mTOR signaling: Implication in disease, Free Radic Biol Med. 100, 231-7.

6. Song G, Qin Y* (2016) (*corresponding author) EF4 reveals the energy barrier for tRNA back-translocation in the peptidyl transferase center, RNA Biol. 13(10), 934-9.

7. Gao Y, Bai X, Zhang D, Han C,Yuan J, Liu W, Cao X, Chen Z, Shangguan F, Zhu Z, Gao F and Qin Y* (2016) (*corresponding author) Mammalian elongation factor 4 regulates mitochondrial translation essential for spermatogenesis, Nat Struct Mol Biol.10.1038/nsmb.3206

8. Zhang D, Kaige Y, Liu G, Song G, Luo J, Shi Y, Cheng E, Wu S, Jiang T, Lou Z, Gao N* and Qin Y* (2016) (*corresponding author) EF4 disengages the peptidyl-tRNA CCA end and facilitates back-translocation on the 70S ribosome, Nat Struct Mol Biol. 23, 125-131

9. Zhang Y, Mandava CS, Cao W, Li X, Zhang D, Li N, Zhang Y, Zhang X, Qin Y, Mi K, Lei J*, Sanyal S*, Gao N* (2015) (*corresponding author) HflX is a ribosome-splitting factor rescuing stalled ribosomes under stress conditions, Nat Struct Mol Biol. 22, 906–913.

10. Zhang D, Kaige Y, Zhang Y, Liu G, Cao X, Song G, Xie Q*, Gao N*, Qin Y* (2015) (*corresponding author) New insights into the enzymatic role of EF-G in ribosome recycling, Nucleic Acids Res. 1674–1683.

11. Liu G, Zhang D, Song G, Li Z, Zhang D, Lyv Z, Aachenbach J, Dong J, Gong W, Zhao X, Nierhaus K H and Qin Y* (2014) (*corresponding author) EF-G catalyzes tRNA translocation by disrupting interactions between decoding center and codon-anticodon duplex, Nat Struct Mol Biol. 21, 817–824.

12. Yang F, Gao Y, Li ZK, Chen LM, Xia Z, Xu T*, Qin Y* (2014) (*corresponding author) Mitochondrial EF4 links respiratory dysfunction and cytoplasmic translation in Caenorhabditis elegans. Biochim Biophys Acta. 1674–1683

13. Yamamoto H#, Qin Y#, Achenhach J#, Li X, Kijek J, Kijek J, Sphan CMT and Nierhaus HK (2014) (#co-first author) EF-G and EF4: Translocation and back-translocation on the bacterial ribosome. Nature Reviews Microbiology, 12 (2) 89-100 (Invited review).

Nominated by “Faculty of 1000”

14. Zhang D and Qin Y* (2013) (*corresponding author) The Paradox of Elongation Factor 4: highly conserved yet of no physiological significance? Biochem. J., 452 (2), 173-181 (invited review)

15. Zhang D, Liu G, Xue J, Lou J, Nierhaus K H, Gong W* and Qin Y* (2012) (*corresponding author) Common chaperone activity in the G-domain of trGTPase protects L11–L12 interaction on the ribosome, Nucleic Acids Res., 40 (21) 10851-10865.

16. Wang L, Yang F, Zhang D, Chen Z, Xu R, Nierhaus K H, Gong W and Qin Y* (2012) (*corresponding author) A conserved proline switch on the ribosome facilitates the recruitment and binding of trGTPases, Nat. Struct. Mol. Biol., 19(4)403-410

17. Di Giacco V#, Marquez V#, Qin Y#, Pech M, Triana-Alonso FJ, Wilson DN, Nierhaus KH (2008) (#co-first author). Shine-dalgarno interaction prevents incorporation of noncognate amino acids at the codon following the aug. PNAS 105(31):10715-10720.

18. Connell SR#, Topf M#, Qin Y#, Wilson DN, Mielke T, Fucini P, Nierhaus KH, Spahn CM (2008) (#co-first author) A new trna intermediate revealed on the ribosome during ef4-mediated back-translocation. Nature Struct. Mol. Biol. 15(9):910-915.

19. Qin Y, Polacek N, Vesper O, Staub E, Einfeldt E, Wilson DN, Nierhaus KH (2006) The highly conserved lepa is a ribosomal elongation factor that back-translocates the ribosome. Cell 127(4):721-733.

Commented by Current Biology (Youngman et al., 17 (4)316-319)

Evaluated by “Faculty of 1000” (http://f1000.com/prime/1089479)

专利

1. Knud H Nierhaus, Yan Qin; Daniel Wilson. The protein factor LepA (EF4) as a new target for antibiotics against bacteria. PCT/EP 2007/008961

2. Knud H Nierhaus, Yan Qin; Daniel Wilson. Use of LepA for improving the accuracy of protein synthesis in vitro. PCT/EP 2006/006503

3. Yan Qin, Yanyan Gao. Usage of the mitochondrial translation factor Guf1 in Male sterility study. 2013104852275

4. 秦燕,郝佳,朱萍. EF4蛋白编码基因沉默在癌症治疗方面的应用（申请号：201210566942.7，证书号第2369805号）（已授权）

5. 秦燕, 高岩岩线粒体蛋白质翻译因子mtEF4/Guf1在雄性不育研究中的应用（申请号201310485227.5 ，证书号第1812912号）（已授权）

资料来源：秦燕研究员，2018-08-02网页更新