康禹

中国科学院北京基因组研究所

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康禹 ( KANG Yu )

职 称: 副研究员
职 务:
E-Mail: kangy@big.ac.cn
学科类别: 基因组学
学习经历:
1999.09—2002.08 北京大学医学院临床医学专业,博士研究生 1991.09—1996.07 北京医科大学临床医学系临床医学专业本科学习
工作经历:

2016.01至今 中国科学院北京基因组研究所,中国科学院基因组科学与信息重点实验室,副研究员 2012.06—2015.12 中国科学院北京基因组研究所,中国科学院基因组科学与信息重点实验室,助理研究员 2010.02—2012.05 中国科学院北京基因组研究所,中国科学院基因组科学与信息重点实验室,博士后 2002.08—2010.02 本元正阳基因技术有限责任公司,新药研发部,经理 1996.09—1999.08 北京大学人民医院,内科,住院医师

主要研究领域:

1.微生物基因组,宏基因组; 2.基因检测方法学及微流控装置。

承担科研项目情况:

1. 中国科学院科研仪器设备研制项目,基于电学特性的高通量活体单细胞分析仪,2018.01-2019.12,在研,骨干; 2. 精准医学国家重点研发计划项目,基于组学特征谱的社区获得性肺炎分子分型研究, 2016.1-2018.12,在研,课题负责人; 3. 国家自然科学基金面上项目,能量调控在细胞表型异质化中的主导作用,2015.01-2018.12,在研,主持;

代表论著:

1.Wu T#, Shao C#, Li L, Wang S, Ouyang Q, Kang Y*, Luo C*. Streamline-based purification of bacterial samples from liquefied sputum utilizing microfluidics. Lab Chip. 2017 25;17(21):3601-3608.

2.Yuan L#, Yu Y#, Zhu Y, Li Y, Li C, Li R, Ma Q, Siu GKH, Yu J, Jiang T, Xiao J*, Kang Y*. GAAP: Genome-organization-framework-Assisted Assembly Pipeline for Prokaryotic Genomes. BMC Genomics. 2017 25;18(Suppl 1):952.

3.Zhu L#, Zhong J#, Jia X#, Liu G#, Kang Y#, Dong M, Zhang X, Li Q, Yue L, Li C, Fu J, Xiao J, Yan J, Zhang B, Lei M, Chen S, Lv L, Zhu B, Huang H, Chen F. Precision methylome characterization of Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) using PacBio single-molecule real-time (SMRT) technology. Nucleic Acids Res. 2015 Dec 23: doi: 10.1093/nar/gkv1498 (IF 9.112, 2014)

4.Kang Y#, Gu C#, Yuan L#, Wang Y, Zhu Y, Li Xinna, Luo Q, Xiao J, Jiang D, Qian M, Khan A A, Chen F, Zhang Z*, Yu J*. Flexibility and symmetry of prokaryotic gene rearrangements reveal species-specific core-gene-defined genome organizational frameworks (cGOFs). MBio. 2014;5(6):e001867-14. (IF 6.991)

5.Gao Z#*, Kang Y, Yu J, Ren L. Human pharyngeal microbiome may play a protective role in respiratory tract infections. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2014 Jun;12(3):144-50.

6.Zhang P, Peng P, Wang L, Kang Y. G-scores: a method for identifying disease-causing pathogens with application to lower respiratory tract infections. Stat Med. 2014 Jul 20;33(16):2814-29.

7.Wang X#, Kang Y#, Luo C#, Zhao T#, Liu L, Jiang X, Fu R, An S, Chen J, Jiang N, Ren L, Wang Q, Baillie JK, Gao Z*, Yu J*. Hetero-resistance at the single-cell level: adapting to antibiotic stress through a population-based strategy and growth-controlled inter-phenotypic coordination. MBio. 2014;5(1):e00942-13. (IF 6.991)

8.Jiang X, Kang Y, Pan X, Yu J, Ouyang Q, Luo C. Studies of the drug resistance response of sensitive and drug-resistant strains in a microfluidic system. Integr Biol (Camb). 2014,6(2):143-51. (IF 4.32)

9.Kang Y#, Deng R#, Wang C#, Deng T#, Peng P, Cheng X, Wang G, Qian M, Gao H, Han B, Chen Y, Hu Y, Geng R, Hu C, Zhang W, Yang J, Wan H, Yu Q, Wei L, Li J, Tian G, Wang Q, Hu K, Wang S, Wang R, Du J, He B, Ma J, Zhong X, Mu L, Cai S, Zhu X, Xing W, Yu J, Deng M, Gao Z*. Etiologic Diagnosis of Lower Respiratory Tract Bacterial Infections Using Sputum Samples and Quantitative Loop-Mediated Isothermal Amplification. PLoS ONE 2012, 7(6): e38743 (IF 4.092)

专利申请

1. 痰液样品中病原菌的快速提纯装置及快速提纯方法 申请号 : CN201710288471.0发明人 : 康禹 ; 罗春雄 ; 邵长君 ; 吴天 ; 于军 ; 林强 ; 王建 ; 楚亚男 ; 付荣荣 ;

2. 宏基因组提取方法 申请号 : CN201210580611.9 发明人 : 任鲁风 ; 王绪敏 ; 楚亚男 ; 高静 ; 谷岚 ; 隋硕 ; 康禹 ; 徐力 ; 袁丽娜 ; 张奕杰 ; 高占成 ; 于军 ;

3. 一种肿瘤细胞疫苗的制备方法 申请号 : CN200410080334.0 发明人 : 吴小兵 ; 康禹 ; 彭建强 ;

4. 应用差示文库制备肿瘤疫苗及其应用 申请号 : CN02124296.8 发明人 : 康禹 ; 吴小兵 ;

社会任职:
获奖及荣誉: