方向东

中国科学院北京基因组研究所

浏览次数

21

收藏次数

0

接洽次数

0

  • 方向东
  • 博士生导师
  • 研究员

方向东 ( FANG Xiangdong )

职 称: 研究员
职 务: 博士生导师
E-Mail: fangxd@big.ac.cn
学科类别: 医学遗传学、精准医学大数据
学习经历:
1986年-1992年 第一军医大学(现南方医科大学) 六年制临床医学 本科 1992年-1995年 第一军医大学 免疫学 硕士研究生 导师王小宁教授、戚正武院士 1996年-1999年 第一军医大学 人体解剖学和组织胚胎学 博士研究生 导师李进教授、戚正武院士
工作经历:
1993-1995 中国科学院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室 访问学者 1995-1996 第一军医大学分子免疫学研究所 助教 1997-1999 中国科学院上海生物化学研究所分子生物学国家重点实验室 访问学者 1999-2000 上海医科大学基因研究中心暨卫生部糖复合物重点实验室 博士后 2000-2003 美国华盛顿大学 医学院 博士后 2003-2007 美国华盛顿大学 医学院 讲师 2007-2009 美国华盛顿大学 医学院 助理研究员 2009-至今 中国科学院北京基因组研究所 研究员
主要研究领域:
干细胞、遗传性血液病和恶性肿瘤的组学数据挖掘与精准医学研究
承担科研项目情况:

1. 国家“十三五” 重点研发计划《精准医学研究》重点专项项目,《精准医学大数据处理和利用的标准化技术体系建设》; 2. 国家“十二五”863计划主题项目,《组学大数据中心和知识库构建与服务技术》; 3. 国家“十二五”重点基础研究发展计划(973)子课题,《肿瘤异质性的转录组与蛋白质组研究》; 4. 国家自然科学基金面上项目,《染色质构象调控lncRNA在造血干细胞红系分化中的作用机制研究》; 5. 国家自然科学基金面上项目,《CTGF通过Wnt途径调节黑色素瘤细胞上皮细胞间质转化》; 6. 国家自然科学基金面上项目,《转录因子KLFs调控干细胞红系分化的分子网络机制》; 7. 中国科学院重点部署项目,《中国人群精准医学研究计划》

代表论著:

1. Li Y#, Zhang Q#, Du Z#, Lu Z, Liu S, Zhang L, Ding N, Bao B, Yang Y, Xiong Q, Wang H, Zhang Z, Qu H, Jia H*, Fang X*. Hsa-miR-200a inhibits erythroid differentiation by targeting PDCD4 and THRB. Brit J Haematol 2017; 176(1): 50-64

2. Wang J#, Ding N#, Li Y#, Cheng H#, Wang D, Yang Q, Deng Y, Yang Y, Li Y, Ruan X, Xie F, Zhao H*, Fang X*. Insulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP5) functions as a tumor suppressor in human melanoma cells. Oncotarget 2015; 6(24): 20636-20649

3. Wang H#, Li Y#, Wang S#, Zhang Q, Zheng J, Yang Y, Qi H, Qu H, Zhang Z, Liu F*, Fang X*. Knockdown of transcription factor forkhead box O3 (FOXO3) suppresses erythroid differentiation in human cells and zebrafish. Biochem Biophys Res Commun 2015; 460(4): 923-930

4. Li Y#, Liu S#, Sun H#, Yang Y, Qi H, Ding N, Zheng J, Dong X, Qu H, Zhang Z, Fang X*. Regulation of ALAS2 by miR-218 during iron metabolism and erythroid differentiation. Int J Mol Sci 2015; 16: 28156-28168

5. Song B#, Zhang Q#, Zhang Z, Wan Y, Jia Q, Wang X, Zhu X, Leung AY, Cheng T, Fang X*, Yuan W*, Jia H*. Systematic transcriptome analysis of the zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia induced by RPS24 deficiency. BMC Genomics 2014; 15: 759

6. Zhao H#, Li Y#, Wang S#, Yang Y, Wang J, Ruan X, Yang Y, Cai K, Zhang B, Cui P, Yan J, Zhao Y, Wakeland EK, Li Q, Hu S*, Fang X*. Whole transcriptome RNA-seq analysis: the tumorigenesis and metastasis of melanoma. Gene 2014; 548(2): 234-243

7. Zhang Z#, Jia H#, Zhang Q, Wan Y, Zhou Y, Jia Q, Zhang W, Yuan W, Cheng T, Zhu X*, Fang X*. Assessment of hematopoietic failure due to RPL11 deficiency in a zebrafish model of Diamond-Blackfan anemia by deep sequencing. BMC Genomics 2013; 14: 896

8. Yang Y#, Wang H#, Chang KH#, Qu H, Zhang Z, Xiong Q, Qi H, Cui P, Lin Q, Ruan X, Yang Y, Li Y, Shu C, Li Q, Wakeland EK, Yan J, Hu S*, Fang X*. Transcriptome dynamics during human erythroid differentiation and development. Genomics 2013; 102(5-6): 431-441

9. Wang Y#, Zhang Z#, Chi Y, Zhang Q, Xu F, Yang Z, Meng L, Yang S, Yan S, Mao A, Zhang J, Yang Y, Wang S, Cui J, Liang L, Ji Y, Han ZB*, Fang X*, Han Z*. Long-term cultured mesenchymal stem cells frequently develop genomic mutations but do not undergo malignant transformation. Cell Death Dis 2013; 4: e950

10. Chang KH#, Fang X#, Wang H, Huang A, Cao H, Yang Y, Bonig H, Stamatoyannopoulos JA, Papayannopoulou T*. Epigenetic modifications and chromosome conformations of the beta-globin locus throughout development. Stem Cell Rev 2013; 9(4): 397-407

11. Xiong Q#, Zhang Z#, Chang KH#, Qu H, Wang H, Qi H, Li Y, Ruan X, Yang Y, Yang Y, Li Y, Sandstrom R, Sabo PJ, Li Q, Stamatoyannopoulos G, Stamatoyannopoulos JA*, Fang X*. Comprehensive characterization of erythroid-specific enhancers in the genomic regions of human Krüppel-like factors. BMC Genomics 2013; 14: 587

12. Wang H#, Hu H#, Zhang Q, Yang Y, Li Y, Hu Y, Ruan X, Yang Y, Zhang Z, Shu C, Yan J, Wakeland EK, Li Q, Hu S*, Fang X*. Dynamic transcriptomes of human myeloid leukemia cells. Genomics 2013; 102(4): 250-256

13. Su RJ#, Yang Y#, Neises A, Payne KJ, Wang J, Viswanathan K, Wakeland EK, Fang X*, Zhang XB*. Few de novo single nucleotide variations in exomes of human cord blood induced pluripotent stem cells. PLoS One 2013; 8(4): e59908

14. Li Y#, Wang H#, Yang B#, Yang J, Ruan X, Yang Y, Wakeland EK, Li Q*, Fang X*. Influence of carbon monoxide on growth and apoptosis of human umbilical artery smooth muscle cells and vein endothelial cells. Int J Biol Sci 2012; 8(10): 1431-1446

15. Fang X, Yin W, Xiang P, Han H, Stamatoyannopoulos G*, Li Q*. The higher structure of chromatin in the LCR of the beta-globin locus changes during development. J Mol Biol 2009; 394(2): 197-208

16. Fang X, Xiang P, Yin W, Stamatoyannopoulos G, Li Q*. Cooperativeness of the higher chromatin structure of the beta-globin locus revealed by the deletion mutations of HS3 of the LCR. J Mol Biol 2007; 365(1): 31-37

17. Fang X, Sun J, Xiang P, Yu M, Navas PA, Peterson KR, Stamatoyannopoulos G, Li Q*. Synergistic and additive properties of the beta-globin LCR revealed by 5'HS3 deletion mutations: Implication for LCR chromatin architecture. Mol Cell Biol 2005; 25(16): 7033-7041

18. Fang X, Han H, Stamatoyannopoulos G, Li Q*. Developmentally specific role of the CCAAT box in regulation of human gamma-globin gene expression. J Biol Chem 2004; 279(7): 5444-5449

19. Fang X, Peterson KR, Li Q, Stamatoyannopoulos G*. Locus control regions. In: Makrides SC, ed. Gene Transfer And Expression In Mammalian Cells. St. Louis: Elsevier Science B.V.; 2003. pp. 397-409

20. Duan ZJ#, Fang X#, Rohde A, Han H, Stamatoyannopoulos G, Li Q*. Developmental specificity of recruitment of TBP to the TATA box of the human gamma-globin gene. Proc Natl Acad Sci USA 2002; 99(8): 5509-5514

专利:

2015,中国专利,201310551809.9 《用于检测人肝癌细胞标志物的引物和探针及其检测试剂盒》

2004,中国专利,CN 1361178 《产生凝血因子VIII的生产方法和宿主细胞》

2002,中国专利,CN 1334084 《含吡咯并喹啉醌的治疗铅中毒的药物组合物》

2001,中国专利,CN 1324821 《新的人促神经营养因子及其编码序列,及制法和用途》

1998,中国专利,CN 1169998 《重组蛋白提取纯化方法》

社会任职:
《发育医学电子杂志》 主编 Genomics Proteomics Bioinformatics 副主编 《遗传》 编委 中国转化医学联盟 理事 人民卫生出版社系列期刊管理委员会 常委 中国医药生物技术协会生物医学信息技术和生物诊断技术专委会 常委 国家科学技术部“人类遗传资源管理”专家委员会 专家 中国卫生信息学会健康医疗大数据政府决策支持与标准化专委会 委员 国家卫生计生委临床遗传专科委员会 委员 中国遗传学会遗传咨询分会 委员 中国生理学会血液生理专委会 委员 中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会 委员 International Society for Stem Cell Research (ISSCR) Member American Society of Hematology (ASH) Member American Association for the Advancement of Science (AAAS) Member American Society of Gene Therapy (ASGT) Member
获奖及荣誉:

2003年 上海市科技进步三等奖,033101 《重组基因工程药物凝血因子VIII的研制与开发》 2000年 广东省科技进步二等奖,2000-J-2-R02-X058 《重组蛋白质表达、复性、纯化新工艺及人G-CSF新药研制》 1998年 国家II类新药证书,(98)卫药证字S-09 《重组人粒细胞集落刺激因子(rhG-CSF)的研制》 1998年 中国人民解放军科技进步三等奖,1998-3-93-3 《IL-2/GM-CSF融合基因的构建,克隆及高效表达》